菌落計數儀通常用于標本中細菌數的檢測，采用節能環形熒光燈側射照明，菌落對比清楚，按照細菌計數檢驗規程規定，儀器顯示器設計為三位數，當一只培養皿中菌落生長數超過300個時，應將檢驗樣品稀釋重作，以保證計數的準確性。
計數儀采用全封閉、寬光帶照明技術，符合人體工學的舷窗門設計，隔絕環境光的干擾，*消除雜散光在玻璃培養皿折射形成的光斑、光環現象。
使用方法：
(1)接通電源，撥動開關計數池內燈亮，顯示屏顯示“001”，將探筆插頭插入儀器的插孔內，按下“復位”鍵調零使儀器進入工作狀態。
（2)放入待檢培養皿。
(3)用探筆在培養皿底面對所有的菌落逐個點數。每點一個應聽到“嘟”聲才說明有效，否則應重點。此時，點到的菌落被標上顏色，顯示數字自動累加。
(4)用放大鏡仔細檢查，確認點數無遺漏，計數即已完畢。
(5)顯示屏內的數字即為該培養皿的菌落數。
(6）記錄數字后取出培養皿。按“復位”鍵，顯示屏進入初始狀態。
菌落計數儀主要的是采取平板菌落計數法技術，該技術是一種常見的活菌計數法，將待測菌液進行梯度稀釋，取一定體積的稀釋菌液與合適的固體培養基在凝固前均勻混合，或將菌液涂布于已凝固的固體培養基平板上，保溫培養后，用平板上出現的菌落數乘以菌液稀釋度，即可算出原菌液的含菌數。
